octave源代码安装之——依赖关系解析(致数学爱好者）

octave源代码安装之——依赖关系解析(致数学爱好者）

我的系统是gentoo 3. 0 .6,gnome-3,gcc-4.5.3,安装好系统，和一些必要的autotool,就可以下载octave 安装，

有些教程（Programming Abstractions in C: A Second Course in Computer Science )说程序90％是依靠库(Library)来完成的，只有很少的一部分是跟据应用来编写的代码，

从octave的源代码安装来看，果然如此。

下载octave-3.4.3.tar.gz,然后解压，建议进入su超级用户进行操作，

tar xvvf octave-3.4.3.tar.gz

cd octave-3.4.3

./configure

make

make install

当第一步，./configure的编译时候，首先是提示依赖BLAS和LAPACK，其实安装LAPACK就包括了BLAS，下载LAPACK，

1，我们现看看LAPACK的来龙去脉，LAPACK－Linear Algebra PACKage 的缩写，线性代数包，就是计算机算法程序，LAPACK的安装是cmake,如果你没有安装cmake,那就首先安装cmake后，再解压tar xvvf lapack-3.4.0.tgz，然后，进入文件夹后，

cmake .

make

make install

LAPACK是一个由: 田纳西大学,加州大学伯克利分校,科罗拉多州丹佛大学和NAG有限公司联合开发并提供的软件包。

LAPACK是用Fortran 90和提供用于求解线性方程组的例程，最小二乘线性系统的方程组，特征值问题，奇异值问题的解决方案。还提供了相关的矩阵因子分解（LU,Cholesky,QR,SVD,Schur,generalized Schur），如舒尔因式分解的重新排序和条件数估计的相关计算。稠密和带状矩阵处理，但不是一般的稀疏矩阵。在所有领域，类似的功能是提供真实和复杂的矩阵，在单精度和双精度。

LAPACK项目最初的目标是使被广泛使用的EISPACK，并有效地共享内存的向量和并行处理器上运行LINPACK库。在这些机器上，LINPACK性能和EISPACK是低效的，因为其内存访问模式不顾机器的多层次的内存层次结构，从而花费太多时间，而不是做有用的浮点运算的数据移动。LAPACK重组的算法，使用块矩阵运算，如矩阵乘法，解决这个问题，在最内层的循环。这些块操作，可以为每个架构进行了优化，占内存层次结构，并提供各种现代化的机器上实现高效率的运输方式。我们使用的术语，而不是“便携式”的“运输”，因为最快的性能，LAPACK的要求，高度优化的分块矩阵操作每台机器上已经实现。

更多信息参考:

http://www.netlib.org/lapack/

2，

当你安装好LAPACK后，再一次进入octave文件夹，octave-3.4.3/$./configure编译的时候，会出现一下的软件依赖关系表，逐一解释吧!

./configure

configure: WARNING: UMFPACK not found. This will result in some lack of functionality for sparse matrices.
configure: WARNING: qrupdate not found. The QR & Cholesky updating functions will be slow.
configure: WARNING: AMD library not found. This will result in some lack of functionality for sparse matrices.
configure: WARNING: COLAMD library not found. This will result in some lack of functionality for sparse matrices.
configure: WARNING: CCOLAMD library not found. This will result in some lack of functionality for sparse matrices.
configure: WARNING: CHOLMOD library not found. This will result in some lack of functionality for sparse matrices.
configure: WARNING: CXSparse library not found. This will result in some lack of functionality for sparse matrices.
configure: WARNING: GLPK library not found. The glpk function for solving linear programs will be disabled.
configure: WARNING: GraphicsMagick++ library not found. The imread function for reading image files will not be fully functional.
configure: WARNING: HDF5 library not found. Octave will not be able to save or load HDF5 data files.
configure: WARNING: Qhull library not found -- this will result in loss of functionality of some geometry functions.
configure: WARNING: FLTK config script not found. Native graphics will be disabled.
configure: WARNING:
configure: WARNING: I didn't find the necessary libraries to compile native
configure: WARNING: graphics. It isn't necessary to have native graphics,
configure: WARNING: but you will need to have gnuplot installed or you won't
configure: WARNING: be able to use any of Octave's plotting commands
configure: WARNING:
configure: WARNING: I didn't find gnuplot. It isn't necessary to have gnuplot
configure: WARNING: installed,but you won't be able to use any of Octave's
configure: WARNING: plotting commands without it.
configure: WARNING:
configure: WARNING: If gnuplot is installed,but isn't in your path,you can
configure: WARNING: tell Octave where to find it by using the gnuplot_binary
configure: WARNING: function. For example,
configure: WARNING:
configure: WARNING: gnuplot_binary ("/full/path/and/name/of/gnuplot/binary")
configure: WARNING:
configure: WARNING: at the Octave prompt.
configure: WARNING:
configure: WARNING: Setting default value to gnuplot
configure: WARNING:
configure:
configure: NOTE: libraries may be skipped if a library is not found OR
configure: NOTE: if the library on your system is missing required features.
(none) octave-3.4.3 #

3，依次解析，

佛罗里达大学贡献此软件包，SuiteSparse.

SuiteSparse: A Suite of Sparse matrix packagesthat I haveauthored or co-authored are available as a single tar or zip file here，

是一个分散矩阵集成软件包，可以将一下软件包放在一个tar包或者zip包，我下载的是SuiteSparse-3.7.0.tar.gz,

具体软件包如下:

• SuiteSparseQR multithreaded multifrontal sparseQR factorization
• AMD: approximate minimum degree
• CAMD: constrainted approximate minimum degree
• CCOLAMD: constrained column approximate minimum degree
• COLAMD: column approximate minimum degree
• CHOLMOD: sparse supernodal Cholesky factorization and update/downdate
• LDL: a simple LDL^T factorization
• UMFPACK: sparse multifrontal LU factorization
• UFconfig : common configurations (for all but CSparse)
• CSparse,: a concise sparse matrix packagea sparse matrix package for my book,Direct Methods for Sparse Linear Systems,published as part ofSIAM's book series on theFundamentalsof Algorithms
• CXSparse: CSparse eXtended,with complex matrices and "long" integers,
• RBio: read/write matrices in Rutherford/Boeing format
• BTF: permutation to block triangular form
• KLU: sparse LU factorization,for circuit simulation
• 
  

英特尔线程构建模块（英特尔TBB）提供了一个丰富而完整的的方式来表达一个C + +程序的并行。它是一个库，可以帮助您利用多核心处理器的性能，而不必是一个线程的专家。英特尔TBB不仅仅是一个线程更换库。它代表了一种更高层次的，基于任务的并行抽象平台的细节和可扩展性和性能的线程机制。

http://threadingbuildingblocks.org/ver.php?fid=180

(3）编译METIS（或者不用METIS），

如果你没有下载METIS，可以选择跳过， 进入并编辑SuiteSparse-3.7.0/UFconfig/UFconfig.mk ，

CHOLMOD_CONFIG = -DNPARTITION

因为METIS是CHOLMOD所依赖的软件包，所以，在CHOLMOD的选项中，－DNPARTITION的解释是不包括分区模块，GNU LGPL 认证，同时也不包括METIS，因此选择这个选项，可以不安装METIS，且可以安装SuiteSparse。

（4）也可以根据需要设置其他的 UFconfig/UFconfig.mk ，

如果你已经编译了 SuiteSparse,然后你有更改了UFconfig/UFconfig.mk,你必须输入“make purge" (或者 ”make realclean"在当前文件夹）

（5）进入SuiteSparse-3.7.0,输入"make",所有的软件包都将安装，如果你仅仅安装库文件而不运行demos，可以输入"make library" 进行安装。

（6）安装，输入"sudo make install ",如果你是超级用户，可以直接输入“make install" 进行安装。 所有的库默认安装在 /usr/local/lib 和 /usr/local/include中。可以在UFconfig.mk 中更改安装路径。

（7） 卸载，超级用户，输入“ make uninstall "即可。

4.

（编辑：安卓应用网）

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